Trama: La storia prende luogo in un mondo in cui l'alchimia è la più avanzata scienza che permette a chi la pratica, gli alchimisti, di plasmare a piacimento la materia seguendo la legge dello scambio equivalente.
I due protagonisti, Edward e Alphonse Elric, dopo esser stati abbandonati dal padre e aver perso la madre in seguito a una malattia tentano di resuscitarla violando così uno dei tabù dell'alchimia. I risultati sono tragici: Alphonse perde il suo intero corpo ed Edward la gamba sinistra.
Ed, disperato, effettua un'altra trasmutazione sacrificando il braccio destro riuscendo così a fissare l'anima del fratello ad una delle armature presenti nella stanza.
Con l'ausilio degli Auto-mail, protesi meccaniche molto avanzate, Edward assieme al fratello tenterà l'esame per diventare Alchimista di Stato, unico modo per iniziare la ricerca della pietra filosofale capace di effettuare trasmutazioni alchemiche ignorando la legge dello scambio equivalente. L'unica speranza per riottenere i loro corpi.
